เครื่องมือสร้างแบบจำลองทางคอมพิวเตอร์จะทำนายตำแหน่งใหม่ของการผูกมัดสำหรับยาที่มีศักยภาพซึ่งคัดเลือกมาอย่างดี นำไปสู่การกำหนดเป้าหมายยาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น เพิ่มประสิทธิภาพในการรักษา และลดผลข้างเคียง
เครื่องมือข้อมูลหรือโปรโตคอลจะเปิดเผยสารประกอบประเภทใหม่ นั่นคือยา allosteric ใน G protein-coupled receptors (GPCRs)
GPCR เป็นตระกูลโปรตีนเมมเบรนที่ใหญ่ที่สุดที่ส่งสัญญาณภายในเซลล์จากฮอร์โมน สารสื่อประสาท และโมเลกุลภายนอกอื่นๆ เป็นผลมาจากอิทธิพลในวงกว้างที่มีต่อสรีรวิทยาของมนุษย์ GPCRs จึงเป็นเป้าหมายของยาในพื้นที่การรักษาหลายอย่าง เช่น การอักเสบ ภาวะมีบุตรยาก ความผิดปกติของการเผาผลาญและระบบประสาท การติดเชื้อไวรัส และมะเร็ง ปัจจุบันยามากกว่าหนึ่งในสามทำหน้าที่ผ่าน GPCR แม้จะประสบความสำเร็จในการรักษาอย่างมาก การค้นพบยา GPCR ก็เป็นเรื่องที่ท้าทายเนื่องจากการผูกมัดที่ยุ่งยากและผลข้างเคียงที่ตามมา
การศึกษาเมื่อเร็ว ๆ นี้ชี้ให้เห็นถึงการมีอยู่ของไซต์ที่มีผลผูกพันอื่น ๆ ที่เรียกว่าไซต์ allosteric ซึ่งยาสามารถผูกมัดและให้ประโยชน์ในการรักษาหลายอย่าง อย่างไรก็ตาม การค้นพบไซต์และยา allosteric เป็นส่วนใหญ่โดยบังเอิญ ผลึกศาสตร์เอ็กซ์เรย์ล่าสุด ซึ่งกำหนดโครงสร้างอะตอมและโมเลกุล และกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบใช้ความเย็นที่มีแบบจำลอง 3 มิติของ GPCR หลายตัวเสนอโอกาสในการพัฒนาวิธีการโดยใช้คอมพิวเตอร์ช่วยในการค้นหาไซต์ที่มีอัลลอสเตอร์
นักวิจัยได้พัฒนาโปรโตคอลที่ใช้คอมพิวเตอร์ช่วยเพื่อทำแผนที่เว็บไซต์ allosteric ใน GPCR เพื่อเริ่มการค้นหายา allosteric อย่างมีเหตุผล นำเสนอโอกาสในการแก้ปัญหาและการรักษาโรคต่างๆ
Dr Irina Tikhonova จาก School of Pharmacy ที่ Queen's University และผู้เขียนอาวุโส อธิบายว่า 'เราได้พัฒนาไปป์ไลน์ที่แปลกใหม่ คุ้มค่า และรวดเร็วสำหรับการค้นพบไซต์ allosteric ของ GPCR ซึ่งเอาชนะข้อจำกัดของโปรโตคอลการคำนวณในปัจจุบัน เช่น การบิดเบือนของเมมเบรน และการผูกมัดแบบไม่จำเพาะเจาะจง
'ไปป์ไลน์ของเราสามารถระบุไซต์ allosteric ได้ในเวลาอันสั้น ซึ่งทำให้เหมาะสำหรับการตั้งค่าอุตสาหกรรม ด้วยเหตุนี้ ไปป์ไลน์ของเราจึงเป็นโซลูชันที่เป็นไปได้ในการเริ่มต้นการค้นหายา allosteric ตามโครงสร้างสำหรับเป้าหมายยาที่มีเมมเบรนซึ่งมีผลกระทบต่อ มะเร็ง การอักเสบ และโรคของระบบประสาทส่วนกลาง'
งานวิจัยชิ้นนี้ตีพิมพ์ใน ACS Central Science เป็นความร่วมมือกับ Queen's University Belfast และ Queen Mary University of London ได้รับการสนับสนุนจากโครงการวิจัยและนวัตกรรม Horizon 2020 ของสหภาพยุโรปภายใต้ข้อตกลงทุน Marie-Sklodowska-Curie และสภาวิจัยด้านเทคโนโลยีชีวภาพและวิทยาศาสตร์ชีวภาพสล็อตออนไลน์ 918kiss
